Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms