Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms