Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms