Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms