Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms