Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.1 ms