Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms