Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGSF9Q9P2J2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms