Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHPF2Q9P2E5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms