Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MIS18AQ9NYP9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms