Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UTP6Q9NYH9 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms