Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDR39U1Q9NRG7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDR39U1Q9NRG7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms