Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PNPLA8Q9NP80 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PNPLA8Q9NP80 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms