Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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