Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C20orf27Q9GZN8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms