Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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