Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms