Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms