Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP9Q99956 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms