Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms