Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FGD4Q96M96 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGD4Q96M96 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms