Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALPK3Q96L96 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms