Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERAC1Q96JX3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms