Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX21Q969T3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms