Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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