Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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USP13Q92995 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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USP13Q92995 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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USP13Q92995 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP13Q92995 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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