Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLF2Q8IX21 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms