Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms