Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTF1AQ7RTS3 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms