Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRIG3Q6UXM1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms