Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 Z95114.2-201ENST00000623490 2205 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms