Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMBRD2Q68DH5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms