Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms