Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNT1Q5JUK3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms