Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms