Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms