Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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GABRA6Q16445 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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GABRA6Q16445 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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GABRA6Q16445 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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GABRA6Q16445 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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GABRA6Q16445 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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GABRA6Q16445 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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