Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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