Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SIX1Q15475 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms