Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms