Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCAPHQ15003 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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