Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GRIN2CQ14957 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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