Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERV3-1Q14264 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERV3-1Q14264 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms