Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms