Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PEX6Q13608 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX6Q13608 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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