Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms