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| NAE1 | Q13564 | AL359711.2-201 | ENST00000563105 | 872 nt | BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC008758.5-201 | ENST00000595562 | 617 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC092364.2-202 | ENST00000597012 | 1073 nt | BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | NOP53-AS1-201 | ENST00000602048 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | TMEM261P1-201 | ENST00000604899 | 340 nt | BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC008494.3-201 | ENST00000606615 | 944 nt | BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC01663-201 | ENST00000614596 | 535 nt | TSL 5 BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
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| NAE1 | Q13564 | GRAPL-201 | ENST00000344415 | 1308 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
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| NAE1 | Q13564 | ZSWIM8-AS1-201 | ENST00000456638 | 1460 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | C4orf19-201 | ENST00000284437 | 1949 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | PLD3-201 | ENST00000356508 | 1906 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.88 | □□□□□ -0.03 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC097376.2-205 | ENST00000610159 | 5334 nt | BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
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| NAE1 | Q13564 | NEBL-203 | ENST00000417816 | 3008 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
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| NAE1 | Q13564 | SF3B4-201 | ENST00000271628 | 2085 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC00116-201 | ENST00000414416 | 2051 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | CLDN22-201 | ENST00000323319 | 2581 nt | APPRIS P1 BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | OR2I1P-210 | ENST00000642037 | 4691 nt | BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RPTOR-203 | ENST00000570891 | 2286 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.87 | □□□□□ -0.03 | | |
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| NAE1 | Q13564 | SLCO4C1-201 | ENST00000310954 | 5334 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.86 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC138517.2-201 | ENST00000637503 | 2594 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.86 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | NPHP4-201 | ENST00000378156 | 4994 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.86 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | NFYC-205 | ENST00000372654 | 1455 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.86 | □□□□□ -0.03 | | |
| NAE1 | Q13564 | C7orf49-201 | ENST00000393114 | 1482 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.86 | □□□□□ -0.03 | | |
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| NAE1 | Q13564 | DHCR7-202 | ENST00000407721 | 2601 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.86 | □□□□□ -0.03 | | |