Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms