Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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TOP3AQ13472 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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TOP3AQ13472 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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TOP3AQ13472 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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TOP3AQ13472 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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TOP3AQ13472 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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