Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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